產(chǎn)品介紹

     基于隨機引物的策略方法，可以實現(xiàn)全樣本類型、全物種、全長單細胞轉(zhuǎn)錄組研究，并且大幅度提高了單細胞測序的基因檢出數(shù)，將極大拓寬單細胞技術的應用領域。

產(chǎn)品特點

    可在單細胞水平準確鑒定基因的可變剪接、可變多聚腺苷酸化（alternative polyadenylation, APA）、融合基因、基因家族和非編碼RNA等信息。

實驗方法

     通過高通量的單細胞轉(zhuǎn)錄組試劑盒、單細胞制備儀、分析軟件組成的完整平臺，可實現(xiàn)對每個樣本1000-20000個細胞進行全長無偏差的轉(zhuǎn)錄組檢測，并進行mRNA、非編碼RNA等研究。使用阻斷引物與裸露的單鏈DNA結(jié)合，通過多次退火和延伸進行原位阻斷。然后，隨機引物和oligo（dT）引物進入細胞核與RNA結(jié)合，對全轉(zhuǎn)錄組的RNA分子進行原位逆轉(zhuǎn)錄。通過末端轉(zhuǎn)移酶（TdT）將 Poly（dA）原位添加到cDNA的3’末端。之后，基于單細胞平臺進行高通量單細胞核標記。最后，進行純化、cDNA擴增、文庫構(gòu)建以及測序分析。

分析內(nèi)容

      細胞鑒定及基因表達定量、細胞亞群分析、APA分析、轉(zhuǎn)錄本融合發(fā)現(xiàn)、特征基因注釋、特征基因功能富集分析、蛋白調(diào)控網(wǎng)絡分析、轉(zhuǎn)錄因子分析、細胞周期分析、擬時序分析、RNA速度分析、細胞通訊分析、GSEA分析、腫瘤拷貝數(shù)變異分析、加權(quán)基因共表達網(wǎng)絡分析。

分析結(jié)果示例圖